1999年，数码世界产生异常并与现实世界的连接发生紊乱.

八神太一、石田大和、武之内空、城户助、泉光子郎、太刀川美美、高石武、八神嘉儿被各自的数码兽召唤到了数码世界，经过重重艰难，最终数码兽们步入究极体战胜了时空的元凶。